Actualmente es profesor de planta del Departamento de Química de la UPN y se desempeña como docente e investigador en los programas de Licenciatura en Química, Maestría en Docencia de la Química y Doctorado en Educación. Sus áreas de interés son la psicología cognitiva, los estilos de aprendizaje, la formación de profesores de ciencias y las políticas sobre educación en ciencia, tecnología y sociedad. Entre sus publicaciones más importantes se pueden mencionar: Algunas precisiones acerca del aprendizaje humano y sus implicaciones para la educación en ciencias ( Zapata y Cárdenas, 2008), Tecnologías de la información y la comunicación en educación química (Salcedo, Villareal, Zapata y Otros, 2008), Desarrollo de habilidades de pensamiento y enseñanza de las ciencias (Rendón y Zapata, 2005), La evaluación de los aprendizajes (Zapata, 2002).