La hegemonía del conocimiento científico ha conllevado a la perdida de saberes ancestrales y tradicionales, a la enculturación y aculturación de diversas culturas. En Colombia los esfuerzos por superar una educación hegemónica han dado lugar a una seria de reformas políticas que si bien representan un paso de lo monocultural a lo multicultural, aún no han permitido trascender a un enfoque intercultural de la educación. En el presente documento se muestran algunos postulados teóricos y metodológicos que hacen parte de una investigación en proceso cuyo objetivo es el estudio de concepciones de profesores en formación inicial acerca de la enseñanza de las ciencias desde el enfoque intercultural. Se establecen algunas consideraciones acerca de una enseñanza de las ciencias intercultural y se presenta cuáles son las concepciones de los profesores acerca de: multiculturalidad, interculturalidad, la enseñanza de las ciencias desde el enfoque intercultural, así como concepciones éticas, filosóficas, del contexto familiar y cultural, concepciones críticas y decoloniales, concepciones de ciencia y de los diferentes tipos de conocimientos que permiten explicar el mundo natural. Finalmente se proponen unas conclusiones respecto al tema estudiado en el marco de sociedades plurietnicas y multiculturales como Colombia.