Para los profesores de primaria, ¿Qué referente prima en el conocimiento escolar? ¿Es el conocimiento científico? ¿Qué relación tiene con otros referentes? Son algunas de las preguntas que se abordan a partir de los resultados de tres estudios de caso con profesores destacables que enseñan ciencias en primaria. Caracterizamos sus saberes sobre el conocimiento escolar y sus posibles relaciones frente a las declaraciones sobre el conocimiento científico. Consideramos que estos conocimientos son epistemológicamente diferenciados y buscamos comprender esas complejas relaciones. Para ello analizamos entrevistas, el diseño de unidades didácticas y las grabaciones de las clases de estos docentes. Los resultados de los casos señalan que no hay una relación causal entre el conocimiento científico y el conocimiento escolar. Estas complejidades son caracterizadas a través de ejes dinamizadores o movilizadores, cuestionamiento y obstáculo, propuestos en la investigación.